실험실과 주요 프로젝트 소개

연구실 소개

• 저희 실험실은 서울시 강남구 일원동 삼성서울병원의 암병원에 위치하고 있으며 성균관대학교 의과대학과 삼성융합의과학원에 공동으로 소속되어 있습니다. 
• 2018년 10월 현재 저희 실험실은 Post-doc. 4분과 석박사 통합과정 대학원 1명으로 구성되어 있으며 KAIST 시스템의학과와 공동연구를 진행하고 있습니다.
• 연구분야는 암미세환경을 구성하는 암연관 섬유아세포 (cancer associated fibroblast)에 집중되어 있으며 이를 다양한 환자 조직과 conditional knock-out mouse를 이용한 in vivo study, 그리고 최신 single cell seqeuncing 및 ChIP-sequencing을 통한 bioinformatic analysis를 동시에 이용해 연구를 진행하고 있습니다. 

연구목적 

• 저희 실험실의 연구목적은 암미세환경을 규명하고 암미세환경 기반의 새로운 암치료 표적을 발굴하여 암치료에 공헌하는 것입니다.
• 또한 암-미세환경을 구성하는 핵심하는 세포인 Fibroblast를 조절하는 전사인자 네트워크를 규명하는 것입니다.

주요 프로젝트

• 암연관 섬유아세포 활성화의 핵심인자인 Prrx1을 중심으로 한된 wound healing program의 규명 및 치료 표적으로서의 가치를 in vivo 동물모델에서의 검증
1. Conditional Prrx1 knock-out mice의 제작과 이를 이용한 wound healing에서의 Prrx1의 기능 확인
2. Mesenchymal embryonic fibroblast에서의 Prrx1 발현 확인과 ChIP-SEQ 및 RNA-seq을 통한 분석 ===> Bioinformatic analysis와 computational simulation을 통해 Prrx1이 master regulator로서 super-enhancer에 binding하는 지 확인.
3. Prrx1이 Wound healing program 관련 transcriptional factor hierachy에서 어느 정도의 위치를 차지하고 있는 지 확인.
4. 대장암 환자 조직에서의 Prrx1 발현 확인 및 임상적의의 확인
5. 각종 in vivo mouse tumor 모델에서 cancer-microenvironment, 그 중에서도 특히 cancer-associated fibroblast에서 Prrx1이 발현되지 않을 때 미치는 영향 확인
• Inducible Twist1 expression mouse 모델을 이용한 암미세환경의 연구
1. Collagen type1a2-promoter rtTA 마우스와 TRE-Twist1 마우스의 확보
2. 이 두가지 마우스를 교배하여 Doxycyclin을 주면 activated fibroblast에서만 Twist1이 발현되는 마우스 모델 확립
3. 이 in vivo mouse에 DMBA/TPA를 이용해 종양발생을 유도하고 종양 주변 섬유아세포에 Twist1발현을 유도했을 때와 안 했을 때를 비교 분석함. 
• Immune-suppressive CAF (cancer associated fibroblast) group의 규명
1. 대장암 환자 조직으로부터 20종 이상의 CAF를 ex vivo culture를 통해 분리 배양함.
2. 이들 colon cancer-CAF와 human T cell과의 coculture를 통해 T cell의 anergy를 유도하는 colon cancer-CAF 발굴 
3. RNAseq과 single cell sequencing을 통해 발굴된 immune-suppressive CAF의 고유 전사인자 및 surface marker 발굴.
4. In vivo model을 이용한 연구결과의 검증.